L’intestin abrite des milliards de microbes, dont des bactéries, des champignons et des virus, collectivement connus sous le nom de microbiome intestinal. Ces micro-organismes jouent un rôle essentiel dans la digestion, le métabolisme et la santé générale. Mais leur fonction la plus cruciale réside peut-être dans la façon dont ils interagissent avec le système immunitaire.
Environ 70 % des cellules immunitaires de l'organisme sont situées dans le tissu lymphoïde associé à l'intestin (GALT), où les réponses immunitaires sont initiées et régulées. Le microbiome agit comme un entraîneur constant pour ces cellules immunitaires, leur apprenant à faire la distinction entre les envahisseurs nocifs et les substances bénéfiques ou neutres. Cela permet de prévenir les maladies auto-immunes, où le système immunitaire attaque l'organisme par erreur, ainsi que l'hyperinflammation, une caractéristique commune à de nombreuses maladies chroniques.